При выявлении фактов недостачи имущества ранее принятый к вычету НДС вовсе не нужно восстанавливать. На это указал налоговикам ФАС Московского округа в постановлении от 31 августа 2012 г. № А41-15463/11. Судьи отметили, что законодательство о налогах и сборах предусматривает исчерпывающий перечень оснований, при которых ранее предъявленные к вычету суммы входящего НДС подлежат восстановлению. Они перечислены в статье 170 Налогового кодекса, и о недостаче в данной норме нет ни слова.

А это означает, что случаи выявленной налогоплательщиком недостачи товаров не являются основанием для восстановления ранее принятого к вычету НДС. К тому же подобные потери не меняют цели ранее совершенных хозяйственных операций по приобретению материальных ценностей. Аналогичная позиция изложена в определении Высшего Арбитражного Суда от 25 ноября 2010 г. № ВАС-14097/10. При таких обстоятельствах арбитры решили, что решение налогового органа о доначислении НДС и соответствующих штрафных санкций не основано на нормах налогового законодательства.