В случае представления налогоплательщиком уточненной налоговой декларации с уменьшенной суммой налога налоговый орган не ограничен трехлетним сроком и имеет право провести повторную выездную проверку. К такому выводу пришел Арбитражный суд Московского округа в постановлении от 11 ноября 2014 г. по делу № А40-54040/13.

Как следует из материалов дела, организация представила в инспекцию «уточненки» за июнь, август, декабрь 2009 года, по которым заявила об уменьшении суммы налога. В связи с этим налоговый орган 29 декабря 2012 года принял решение о проведении повторной выездной проверки.

Со своей стороны компания утверждала, что раз данный документ был получен в 2013 году, то, соответственно, трехлетний период для проведения повторной проверки истек. А стало быть, 2009 год проверяться ну никак не может. Они отметили, что повторная выездная проверка налогоплательщика может проводиться налоговым органом, ранее проводившим проверку, в случае представления уточненной налоговой декларации, в которой указана сумма налога в размере, меньшем ранее заявленного. При этом проверяется период, за который представлена такая декларация. А потому ограничение проверяемого периода тремя годами не распространяется на случаи представления уточненных деклараций, и это никоим образом не нарушает права и законные интересы налогоплательщика.