Наличие заключенного между сторонами сделки соглашения об электронном документообороте в части счетов-фактур не препятствует выставлению счета-фактуры на бумажном носителе. Причем одновременное (повторное) выставление счета-фактуры в электронном виде не производится. Об этом сообщает ФНС в письме от 17 июня 2013 г. № ЕД-4-3/10769. Чиновники также отметили, что в том случае, если истребуемые налоговым органом документы составлены в электронном виде по установленным форматам, то согласно пункту 2 статьи 93 Налогового кодекса налогоплательщик вправе направить их в инспекцию по ТКС.

Специалисты ФНС также напомнили, что Порядок заполнения показателей счетов-фактур при осуществлении операций по договору комиссии, агентскому договору предусмотрен пунктом 1 Правил заполнения счета-фактуры, применяемого при расчетах по НДС (утв. постановлением правительства от 26 декабря 2011 г. № 1137). При этом данный порядок распространяется на счета-фактуры, выставляемые как на бумажном носителе, так и в электронном виде. Причем в электронный счет-фактуру, равно как и в его бумажный аналог можно при необходимости внести какие-либо дополнительные реквизиты. Данная возможность предусмотрена в приказе ФНС от 5 марта 2012 г. № ММВ-7-6/138 «Об утверждении форматов счета-фактуры, журнала учета полученных и выставленных счетов-фактур, книги покупок и книги продаж, дополнительных листов книги покупок и книги продаж в электронном виде».